В России многие необычные виды морских птиц взяты под охрану. В федеральной Красной книге числятся, например, красноногая моевка, алеутская крачка, белая чайка, черноголовый хохотун. В региональные Красные книги Дальнего Востока включены краснолицый баклан (Камчатка), очковый чистик (Сахалин), другие редкие виды.
Большое значение имеют ООПТ — особо охраняемые природные территории. Практически все крупные колонии дальневосточных птиц находятся в заповедниках и национальных парках:
- Командорский биосферный заповедник охватывает весь архипелаг.
- Курильский заповедник защищает южные Курилы и прилегающие воды.
- Кроноцкий заповедник на Камчатке включает прибрежные острова (показательно, что один из них называется Старичков — в честь птичьей колонии).
- Шантарские острова — национальный парк, созданный для охраны уникальной природы Охотского моря, включая птичьи базары.
- Дальневосточный морской биосферный заповедник в заливе Петра Великого (Приморье) опекает небольшие колонии бакланов и чистиков. Кроме того, существуют памятники природы и заказники на ключевых птичьих островах.
- «Берингия» — национальный парк федерального значения, где гнездятся 157 видов пернатых.
- Остров Врангеля. Заповедник с 2004 года носит статус объекта всемирного наследия ЮНЕСКО. Здесь зафиксировано около 170 видов пернатых (большинство прилетают на временную стоянку).
Большую пользу природоохране приносит участие волонтерство. Ежегодно добровольцы, под руководством специалистов, помогают учёным проводить учёты на Командорах и Курилах. Любой бердвочер может внести свой вклад, сообщив о наблюдениях через платформу City Nature Challenge — эти данные используются для отслеживания миграций, контроля изменений численности.